Lyon'da bağırsak mikrobiyotasının vaatleri

Çok sayıda tıbbi yeniliğin taşıyıcısı olan bağırsak mikrobiyotası, Lyon'da öncü araştırma ve yeniliklerin konusu olup, özellikle biyoteknoloji şirketi MaaT Pharma tarafından yürütülmektedir.
Bu makale Lyon Capitale'nin Mayıs 2024 tarihli 843. sayısında yayımlanmıştır.
-80°C'lik bir dondurucudan Carole Schwintner dikdörtgen bir karton kutuyu tutuyor: "Bu ilk ilacımız MaaT013," diye tanıtıyor MaatPharma'nın teknoloji direktörü. 2023'ün sonunda, Lyon merkezli biyoteknoloji şirketi, ilaç alt yüklenicisi SkyePharma ile ortaklaşa Saint-Quentin-Fallavier'de (Isère) ilk fabrikasını açtı. ZAC'ın (Üretim Bölgesi) kalbinde bulunan üretim tesisi, "otoyola, tren istasyonuna ve havaalanına yakın" ideal bir konumda. Bu büyük bir avantaj, çünkü burada üretilen ilaçlar günlük olarak çok taze bir bileşenin, insan dışkısının teslimatını gerektiriyor. Yeni açılan fabrika, mikrobiyota bazlı tedaviler üreten Avrupa'daki az sayıdaki fabrikadan biri ve en büyüğü. Dünyada bu aşamada, "bu türden sadece üç ilaç, ikisi Amerika Birleşik Devletleri'nde ve biri Avustralya'da, piyasada" ve MaatPharma kendini sektördeki öncülerden biri olarak konumlandırıyor. Sağlıklı donörlerin mikrobiyal topluluğunu dışkı yoluyla ihtiyacı olan hastalara yeniden aşılamaktan oluşan bu terapötik inovasyon alanı, küresel ölçekte hala emekleme aşamasındadır. Ancak çok umut verici terapötik ufuklar açmaktadır.
Bunu anlamak için kökenlere geri dönelim ve Lyon'daki Cité de la Gastronomie'ye girelim. Sergide bağırsak mikrobiyotasına, bağırsak ve kolonda bulunan bakteri, virüs, mantar ve arkea ekosistemine adanmış etkileşimli bir destan var. Mikrobiyal topluluk en verimli zemini vücudun bu kısmında bulur: Her bireyin, arazide yürürken öğrendiğimiz gibi, 250 ila 300 farklı türe ait 40 milyar bakteriye ev sahipliği yapmaktadır. Her bir bireye özgü bu topluluk, tıpkı bir parmak izi gibi, “genlerimize, doğumumuza, çevremize, beslenmemize, sağlığımıza bağlı olarak zaman içinde vücudumuzla etkileşime giren ve gelişen yaşam tarihimizin bir sentezidir” diye açıklıyor. Croix-Rousse hastanesinde gastroenterolog olan ve Auvergne-Rhône-Alpes bölgesinde konuyla ilgili otuz kadar uzmanı bir araya getiren Mikrobiyota Çalışma Grubu’nun kurucu ortağı olan Dr. Nicolas Benech, “farklı tıbbi disiplinlerdeki konuyla ilgili uzmanlıkları bir araya getirerek etkili klinik uygulamalara yol açan araştırmalar oluşturmak” amacıyla çalışıyor.
Carole Schwintner, son yirmi yılda bağırsak mikrobiyotası hakkındaki bilgimizin , "DNA dizilimi yoluyla bir topluluktaki tüm bakterileri aynı anda tanımlamayı mümkün kılan metagenomikteki teknolojik gelişmeler sayesinde" ilerlediğini açıklıyor. Araştırmalar, bu ekosistemin vücudumuzda yalnızca sindirimde değil, aynı zamanda merkezi sinir sistemini düzenlemede, nöronal aktiviteyi düzenlemede ve özellikle bağışıklık sistemini düzenlemede oynadığı sayısız işlevi yavaş yavaş keşfetti. Vücudumuzun karşılaştığı mikroorganizmalarla temas yoluyla oluşturulan ikincisine çok yakından bağlı olan mikrobiyotanın durumu -ki bu mevcut mikroorganizmaların miktarına ve çeşitliliğine bağlıdır- bu nedenle belirli hastalıkların gelişmesini veya gelişmemesini de etkiler. Ve onları ağırlaştırmaya... veya kontrol altına almaya katkıda bulunabilir.

Bu, önemli terapötik perspektifler açar. Dr. Benech, "Fikir, mikrobiyotayı önlemek ve tedavi etmek için bir sağlık yardımcı faktörü olarak kullanmaktır," diye devam ediyor. Sağlıklı bir birey için, mikrobiyotalarının zenginliğini korumak, öncelikle onu lif açısından zengin, et ve işlenmiş gıdalar açısından düşük bir diyetle beslemeyi içerir. Ancak hasta insanlarda, bazen tükenmiş bir mikrobiyotayı yeniden inşa etmek için başka yolların keşfedilmesi gerekir. Mikrobiyotaya dayalı terapötik yeniliklerin devreye girdiği yer burasıdır. Bunlar, Onco-Nutribiota projesi tarafından teşvik edildiği gibi, yetersiz beslenen kanser hastaları için kişiselleştirilmiş yiyeceklerin yaratılmasını veya Dr. Benech tarafından paylaşılan iki tutku olan yeni nesil probiyotiklerin geliştirilmesini içerebilir. Diğer durumlarda, çözüm başka bir yerden doğrudan bir mikrobiyotayı yeniden aşılamayı içerir; buna dışkı mikrobiyota transferi denir. Zaten kendi dışkı bankasına sahip olan Croix-Rousse Hastanesi'nde uygulanmakta olan bu yöntem, yalnızca çok özel vakalarda rutin bakım için ve bazen de terapötik bir çıkmaza girmiş hastalar için şefkat gerekçesiyle yetkilendirilmiştir. Ancak kapsamı, özellikle onkoloji alanında klinik denemeler başlatıldıkça giderek genişlemektedir.
Bu alan—ve özellikle onkohematoloji, kan kanserleri—2014 yılında INRAE'den yapılan bir teknoloji transferiyle oluşturulan MaatPharma'nın en başından beri ana stratejik odak noktası olmuştur. Carole Schwintner, "Bu kanserlerde hastalar mikrobiyotalarının ve dolayısıyla bağışıklıklarının hastalık ve maruz kaldıkları çok ağır tedaviler (kemoterapi, antibiyotikler) nedeniyle zayıfladığını görürler. Çeşitli bir mikrobiyotanın yeniden yerleştirilmesi hem tedavinin hem de kanserin etkileriyle mücadeleye yardımcı olur," diye açıklıyor. En gelişmiş ilaçları olan MaaT013, genellikle lösemi hastalarında görülen greft-versus-host hastalığının tedavisinde kullanılır. Kemoterapi ve antibiyotiklerden sonra bazen hastaya yeni bir bağışıklık sistemi nakletmek gerekir. İkincisi bazen çok agresif cilt, karaciğer ve özellikle gastrointestinal semptomlara neden olan bir reaksiyonla konağına karşı döner. "İki aylık yaşam beklentisi %20 olan hastalara üçüncü basamakta müdahale ediyoruz."
On gün boyunca üç kez lavmanla uygulanan bu tedavi, yeni Isère fabrikasında dört ila sekiz donörden alınan dışkıların bir karışımından üretilir - bakteri miktarını en üst düzeye çıkarmak için - elle seçilir (adayların yalnızca %1'i donör olur) ve bir kriyoprotektan solüsyonunda süspanse edilir. Bu uzmanlık, yalnızca bu tür tedaviye adanmış bir altyapı gerektirir: 650 m2'lik fabrika, üst kattaki geliştirme laboratuvarını ve zemin kattaki üretim odalarını barındırır ve herhangi bir patojenik elementin kaçmasını önlemek için sıkı bir sınırlamaya - seviye 2 - tabi tutulur. Üretim süreci ayrıca malzemenin oksijenden korunmasını gerektirir çünkü "bakterilerin yaşadığı yerde oksijen yoktur" .
Bu ilaç için klinik deney şu anda 75 hasta üzerinde yürütülen üçüncü fazında ve MaatPharma 2026'da piyasaya sürmeyi hedefliyor ve Avrupa'da yaklaşık 2.000 ila 3.000 hastayı kapsayan bir ticari hedef belirliyor. "2. fazda hastaların %38'i tedaviye yanıt verdi, yani tedavinin başlamasından sonra 28 gün hayatta kaldılar ve ishalde azalma oldu." Metastatik melanomlar gibi katı tümörlerde tedavinin kullanılması olasılığı için de olasılıklar ortaya çıkıyor. "Literatür, mikrobiyotanın kalitesinin bu kanser türüne karşı kullanılan tedaviler olan immünoterapilere yanıtı etkilediğini gösteriyor." İlacın başka bir formülasyonu şu anda klinik denemelerin 2. aşamasında geliştiriliyor ve Saint-Quentin tesisinde üretilecek: aynı karışımı içeren, kurutulmuş ve liyofilize edilmiş, sadece kolonda açılan bu kapsül, doğrulanırsa kan kanserleri için tedavilere eşlik eden bir ürün olarak sunulacak ve yılda 40.000 kişiyi hedefleyebilir - ayrıca Lou Gehrig hastalığında potansiyel kullanımını değerlendiren bir çalışma da var. Üçüncü nesil ilaçlar değerlendiriliyor. Hızını sürdürmek için, halihazırda 115 milyon avro toplamış olan biyoteknoloji şirketi 2024'te yeni bir finansman turu hazırlıyor.
Lyon Capitale