Covid, итальянский охотник за вариантами: «Вот как я перехватил Nimbus»

Первые признаки заболевания были обнаружены 22 января 2025 года. Фактически, по данным Всемирной организации здравоохранения, первый собранный образец датируется именно этой датой. С тех пор новый вариант Sars-CoV-2, находящийся под особым наблюдением, NB.1.8.1, уже прозванный экспертами в социальных сетях «Нимбусом», разрастался в тишине . Первым ее заметил итальянский охотник за вариантами Федерико Гуэли . В 2025 году он сообщил Adnkronos Salute : «Китай загрузил очень мало последовательностей». Затем в определенный момент цифры начали расти. «И когда страна начинает загружать больше последовательностей, мы повышаем уровень внимания. Теперь, когда активность отправки последовательностей снизилась, мы можем проверять их одну за другой, и это проще. С помощью рутинной работы, которую мы выполняем ежедневно, мы отслеживаем родословные сплошным образом». Во время бума COVID «нам даже удалось одновременно контролировать 450 из них. Мы проверяем, растут ли они, какие у них мутации и какие у них преимущества».

В этом случае прародитель варианта Nimbus уже доминировал в Китае, «и я, — продолжает реконструкцию Гуэли, — заметил 3 или 4 последовательности с мутациями , одна из которых уже появилась и считалась полезной в других линиях. Поэтому я предложил ее системе Pango», платформе открытого доступа, которая отслеживает то, что теперь стало огромным деревом последовательностей, полным разветвлений, которое фотографирует эволюцию Covid.

Возвращаясь к новой записи NB.1.8.1, сегодня она классифицируется как вариант, находящийся под наблюдением ВОЗ . В отчете агентства ООН поясняется, что это линия, произошедшая от XDV.1.5.1, которая, в свою очередь, является потомком JN.1. По сравнению с доминирующим в настоящее время вариантом Sars-CoV-2, LP.8.1, у Nimbus имеются дополнительные мутации шипов в положении, которое, как считается, увеличивает трансмиссивность. По состоянию на 18 мая в базу данных Gisaid из 22 стран было отправлено 518 последовательностей NB.1.8.1 (но сегодня «их уже более тысячи», уточняет Гели), что составляет 10,7% последовательностей, доступных в мире на 17-й эпидемиологической неделе 2025 года, которая проходит с 21 по 27 апреля. Хотя процент остается низким, как предупредила ВОЗ, это значительный рост по сравнению с 2,5%, зарегистрированными 4 неделями ранее (с 31 марта по 6 апреля 2025 года). Этот вариант также был обнаружен в более широком распространении в европейском регионе — от 1% до 6%.

Вариант Нимбус «безусловно имеет китайское происхождение», объясняет Гели. Это продукт «множественных рекомбинаций, которые рекомбинировали по очереди в течение длительного периода времени и продолжали развиваться». По ее словам, выбранное для нее прозвище «отсылает к облаку и было выбрано потому, что оно напоминает букву Nb в имени». «Но это не единственный вариант, за которым мы следим». «Научные исследования, которые у нас есть на данный момент, оперативно проведенные также по NB.1.8.1» группой китайского ученого «Юньлун Цао», а также благодаря работе сообщества «охотников за вариантами», «выделили еще один интересный вариант, еще один рекомбинант, XFG. Все варианты, которые мы замечаем на данный момент, являются рекомбинантными. Вероятно, вирус на этой стадии больше не может получить преимущество только за счет эволюции, и ему удобно смешивать части генома, чтобы собрать воедино наиболее выгодные мутации, смесь большей уклончивости и лучшей трансмиссивности».

Затем Гуэли объясняет историю индийского варианта. « В настоящее время эта страна не проводит много секвенирования , но мы также смотрим на последовательности в американских аэропортах, образцы, секвенированные у путешественников, въезжающих в Америку. В некоторых из них есть указание на страну происхождения. Примерно в 50% последовательностей из этой страны обнаружен новый вариант. Хотя в некоторых последовательностях это показательно до определенного момента, это признак того, что распространенность в Индии довольно высока. Прямо в тот же период мы также замечаем, что есть журналистские отчеты из рассматриваемой страны, которые указывают на рост случаев в определенной области. Этот вариант кажется довольно быстрым и может быть третьим типом эволюции, он имеет в мутациях спайков, впервые обнаруженных в Африке, которые рекомбинировали несколько раз, давая начало различным линиям. «Индийская линия», - говорит Гуэли, «только что была обозначена как XFP». И работа охотников за вариантами продолжается.